C-peptyd jest markerem endogennej produkcji insuliny, pozwalającym ocenić funkcję komórek β trzustki. Badanie poziomu C-peptydu stosuje się w diagnostyce różnicowej cukrzycy typu 1 i typu 2, ocenie insulinoma (guza produkującego insulinę) oraz monitorowaniu terapii insulinowej. Niski poziom C-peptydu wskazuje na niewystarczającą produkcję insuliny przez trzustkę, co jest charakterystyczne dla cukrzycy typu 1.